|
課程名稱 |
生物資訊學
Bioinformatics |
|
開課學期 |
105-2 |
|
授課對象 |
學程 生物統計學程 |
|
授課教師 |
阮雪芬 |
|
課號 |
LS5075 |
|
課程識別碼 |
B21 U2190 |
|
班次 |
|
|
學分 |
3.0 |
|
全/半年 |
半年 |
|
必/選修 |
必修 |
|
上課時間 |
星期四7,8,9(14:20~17:20) |
|
上課地點 |
|
|
備註 |
Ｂ群選擇必修。課程要求：已修畢生物化學或分子生物學。上課地點：博雅408教室。
總人數上限：30人 |
|
Ceiba 課程網頁 |
http://ceiba.ntu.edu.tw/1052LS5075_bi |
|
課程簡介影片 |
|
|
核心能力關聯 |
本課程尚未建立核心能力關連 |
|
課程大綱
|
|
為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
|
|
課程概述 |
生物資訊學是結合分子生物學和電腦的科學，主要著重在利用電腦資料庫、演算法及統計學分析基因體和蛋白質體相關資料。課程除了教授基本的生物資訊學相關知識外，亦進行電腦實作分析，進而使學生了解並能應用於生物科學的研究上。 |
|
課程目標 |
學生將能了解現今生物資訊學的知識，同時能將所學應用於生物學的研究。 |
|
課程要求 |
已修過生物化學或分子生物學 |
|
預期每週課後學習時數 |
|
|
Office Hours |
|
|
指定閱讀 |
1. Jonathan Pevsner, Bioinformatics and Functional Genomics (2nd edition,
Wiley-Blackwell, 2009) + (3rd edition, 2015)
2. Juan, H.-F. and Huang, H.-C. (2012) Systems Biology: Applications in cancer-related research (World Scientific Publishing, Singapore).
|
|
參考書目 |
生物資訊相關的期刊論文: Bioinformatics (Oxford), Nature, Science, Molecular Systems Biology |
|
評量方式
(僅供參考) |
|
No. |
項目 |
百分比 |
說明 |
|
1. |
期中考 |
35% |
筆試 + 上機 |
2. |
作業 + 隨堂考 |
30% |
每周作業 + 隨堂考 |
3. |
期末考 |
35% |
筆試 + 上機 |
|
|
週次 |
日期 |
單元主題 |
|
第1週 |
2月23日 |
Introduction |
|
第2週 |
3月2日 |
Access to sequence data and literature information
(許家郎博士) |
|
第3週 |
3月9日 |
Pairwise sequence alignment |
|
第4週 |
3月16日 |
Basic Local Alignment Search Tool (Blast) |
|
第5週 |
3月23日 |
Multiple sequence alignment |
|
第6週 |
3月30日 |
Molecular phylogeny and evolution |
|
第7週 |
4月6日 |
Bioinformatic approaches to RNA |
|
第8週 |
4月13日 |
Gene expression data analysis |
|
第9週 |
4月20日 |
期中考 (筆試 + 上機) |
|
第10週 |
4月27日 |
Network biology |
|
第11週 |
5月4日 |
Bioinformatics software practice I
(許家郎博士) |
|
第12週 |
5月11日 |
Proteomics |
|
第13週 |
5月18日 |
Protein Structure |
|
第14週 |
5月25日 |
Discovering drug targets for cancer therapy |
|
第15週 |
6月1日 |
Bioinformatics software practice II
(許家郎博士) |
|
第16週 |
6月8日 |
Bioinformatics software practice III
(許家郎博士) |
|
第17週 |
6月15日 |
期末考 (筆試 + 上機) |
|